Alvin y las ardillas 2 cuenta la historia de Alvin, Simon y Theodore, quienes son unas adorables ardillas, las cuales por ciertos problemas de su dueño se veran apartadas de este y reubicadas con una nueva familia que solo las querran para explotarlas.

Sin embargo nada sera color de rosa, ya que a pesar de sus constantes intentos de alejarse de esta nueva familia todos son fallidos, es asi como planearan y uniran fuerzas con otras ardillas hembras de las cuales se enamoraran para poder lograr su cometido, terminando por volver a estar los tres junto a su dueño.

Alvin, Simon y Theore son tres ardillitas que han ido a un compositor desesperado para que las pruebe.  Para ayudarle a este compositor le piden que las permita estar en su casa de él para demostrarle  que no solo pueden vivir unidos, Para  Dave será difícil convivir con estas ardillas.

A bordo de un crucero, las ardillas y las Chipettes caen al agua por accidente y terminan varados en un paraíso tropical. Ellos descubren que la isla no está tan desierta como parece.

Alvin, Simon y Theodore han entrado en una carrera de globos de aire caliente en todo el mundo junto con las Chipettes para ir tras un grupo de contrabandistas de diamantes. Los ganadores deberán recoger un premio de $ 100.000.